La paleta organiza las transiciones en carpetas. Estas carpetas se abren o cierran mediante el triángulo que aparece a la izquierda del nombre de la carpeta.

Arrastrando una transición hacia arriba o abajo, cambiará su posición, siendo posible incluso cambiarla de carpeta. También las carpetas pueden cambiarse de lugar simplemente arranstrando

El menú de la paleta ofrece las siguientes opciones de personalización:

• Find: Permite buscar una transición por su nombre. Se buscará la primera transición en cuyo nombre aparezca la palabra introducida. Tras ello puede pulsarse Find Next para ir a la próxima transición en la que aparezca la palabra. Tiene el mismo efecto que pulsar el botón (), en la parte inferior de la paleta.
• New folder: Crea una nueva carpeta. Tiene el mismo efecto que pulsar el botón New Folder () que se encuentra en la parte inferior de la paleta. Tras crear una nueva carpeta podrá arrastrar a ella las transiciones que desee.
• Rename folder: Permite cambiar el nombre de una carpeta
• Delete folder: Borra la carpeta seleccionadada. Tiene el mismo efecto que pulsar el botón Delete Folder () existente en la parte inferior de la paleta. Cuando se borra una carpeta, las transiciones dentro de ella quedan ocultas, y si se trataba de una carpeta personalizada (creada mediante New Folder) a la que se habían arrastrado transiciones, todas las transiciones dentro de ella vuelven, además, a su lugar original.
• Expand all folders: Expande todas las carpetas
• Collapse all folders: Colapsa todas las carpetas
• Show Hiden: Cuando esta opción se activa, las transiciones que se han ocultado (mediante Hide Selected) se muestran, aunque atenuadas. Se puede usar por lo tanto esta opción para deshacer el efecto de la opción Hide Selected: Podemos mostrar todas las transiciones, seleccionar las transiciones ocultas que queramos restaurar, y elegir Show Selected.
• Hide / Show Selected: Esta opción tiene un nombre u otro dependiendo de qué transiciones estén seleccionadas: Si se han seleccionado transiciones que se muestran en la paleta, la opción se denomina Hide Selected y permite ocultarlas. Por el contrario, si sólo hay seleccionadas transiciones ocultas, esta opción se denomina Show Selected, y deshace el efecto de la anterior. Una transición oculta sigue existiendo, pero no se muestra en la paleta a no ser que la opción Show Hiden esté marcada.
• Set selected as default: Convierte la transición seleccionada en la transición por defecto. Consulte Especificación de la transición por defecto.
• Animate: Funciona como un conmutador para animar los iconos de las transiciones, de tal modo que se muestra, más o menos, el efecto de la misma. Si los iconos ya están animados, pulsando de nuevo esta opción se detendrá la animación.